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两岸四地高等教育的交流互通进入了崭新阶段。大陆高校自新中国成立后就开始面向台港澳地区招生，并在改革开放以后不断扩大招生规模、调整招生政策，吸引台港澳学生来大陆接受高等教育；香港和澳门的大学在两地回归祖国以后也开始有计划地招收大陆学生。而台湾方面一直不承认大陆高校的学历，也不允许台湾高校招收大陆学生，直到2010年8月，台湾立法机构经过激烈辩论后通过 “陆生三法”，有条件地开放大陆学生赴台求学，尽管限制依然非常多，但毕竟迈出了对大陆开放的关键一步，首批大陆学生将于2011年9月赴台就读。这实际上标志着大陆地区、台湾地区、香港特别行政区和澳门特别行政区的高校大门终于向彼此敞开，两岸四地高等教育的交流互通已经进入了崭新阶段。（延伸阅读“两岸四地互相招生及学历认可的历史变迁” ）两岸四地的高校在教育理念、培养目标、课程设置、教学方法等方面各具特色，相互开放使得学生有了多元选择的机会，更有利于实现学生的个性化发展。
两岸四地高水平大学开始在国际上崭露头角。世界一流大学和高水平研究型大学是一个地区的教育实力和科技水平的重要标志，也是一个地区经济社会持续发展和文化影响力的关键因素。基于对世界一流大学在地区发展中的战略性地位的认识，自上世纪末期以来，两岸四地不约而同地开始了世界一流大学的重点建设。例如，大陆地区分别在1995年和1999年启动实施了“211工程”和“985工程”（延伸阅读 ），台湾地区自2005年开始实施“迈向顶尖大学计划”（延伸阅读 ），香港特别行政区大学教育资助委员会自1999年开始实施“卓越学科领域计划”（延伸阅读 ）等，这些重点建设有力地支持了两岸四地高水平大学的发展，极大地提升了他们的整体实力和国际竞争力，近年来两岸四地大学在世界大学体系中的位置不断提前。在两岸四地高等教育相互认可、相互招生进入崭新阶段之际，在两岸四地的世界一流大学和高水平研究型大学建设成效初显之时，对两岸四地的研究型大学按照统一的质量和表现指标进行比较，可以了解他们的相对位置和比较优势。这有助于学生挑选更符合自己期望、更适合自己的大学，有助于大学对自身进行科学定位和设计发展路径，有助于教育管理和资助部门制定有关政策和实施改革计划，最终推动两岸四地高等教育国际竞争力的共同提升。 两岸四地大学排名的数据主要来自三个渠道。
第一个渠道是国际性的数据库，比如诺贝尔基金会的网站，科学引文索引（SCI）和社会科学引文索引（SSCI）数据库，德温特（Derwent）专利创新索引数据库等。
第二个渠道是官方发布的统计数据。大陆地区、台湾地区和澳门地区大学的教师、学生、经费等数据主要来自当地教育主管部门发布的高校统计资料。
第三个渠道是由该中心独立开展的世界研究型大学调查（Global Research University Profiles），由于香港地区可用的高等教育统计数据较少，所以该地区大学的教师、学生和经费等数据主要来自其调查。
延伸阅读“排名方法之排名数据来源 ” 两岸四地大学排名是第一个真正意义上的中国大学排名。以往尽管在大陆地区、台湾地区、香港特别行政区出现过十余个“中国”大学排名，但是这些排名的对象一般都仅限于本地区的大学。两岸四地大学排名是第一个以整个大中国地区的大学为对象，在统一的标准下进行的排名。
除了提供各个学校的总得分以外，排名还提供了学校在每个原始指标上的得分，从而允许他人检验核实每所大学在各个具体指标上的表现和位置情况。而此前的国内大学排名都只是给出学校的总得分或者若干个原始指标加权后的类别得分（如人才培养得分、科学研究得分），很少公布各大学在单项指标上的得分和名次，使得外界无法对排名结果进行检验和重复。
