2016年世界大学排名中，中国内地共有41所大学上榜，其中，清华大学和北京大学今年首次入围世界百强，中国地质大学（武汉）、电子科技大学等9所大学首次跻身世界五百强。
清华大学，北京大学率先取得历史性突破，挺进世界百强，分别排在58名和71名。浙江大学、上海交通大学、复旦大学、中国科学技术大学相比去年也都有明显进步，处在世界第101-150名。哈尔滨工业大学和西安交通大学首次进入世界两百强，中山大学是世界两百强中唯一的一所C9以外的中国内地大学。
排名最高的是北京大学（第53位）,然后是清华大学(第57位)、复旦大学（第121位）、中国科学技术大学（第136位）、上海交通大学（第138位）、浙江大学（第138位）、南京大学（第187位）。
一共有87所中国大陆高校进入围全球最佳1000所大学总排行榜,排名大多分布在800-900名的范围内。
中国香港地区香港大学(第106位)、香港中文大学(第154位)、香港科技大学(第164位)、香港城市大学(第194位)。
