报关单上的境内货源地和发票上的不一致是会影响退税的，要取得出口退税必须使货源地和报关资料产地一致。依据《中华人民共和国进出口货物原产地条例》第二十四条：进口货物的原产地标记与依照本条例所确定的原产地不一致的，由海关责令改正。出口货物的原产地标记与依照本条例所确定的原产地不一致的，由海关、出入境检验检疫机构责令改正。如果发票上地址有错，应该作废重开；如果报关人员操作或者书写失误造成所申报的报关单内容有误，并且未发现有走私违规或者其它违法嫌疑的，企业可以向海关申请改单。
企业应当向现场海关如实反映线、《进出口货物报关单修改/撤销申请表》；2、有关单证：（1）可以证明进出口实际情况的合同、发票、装箱单等相关单证；（2）外汇管理、国税、检验检疫、银行等有关部门出具的单证；（3）应税货物的海关专用缴款书、用于办理收付汇和出口退税的进出口货物报关单证明联等海关出具的相关单证。（4）海关要求提供的其他材料。如报关单的出口退税率已经核销的，企业需要同时出具已核销证明资料。由于每个海关所要求的资料有所不同，以当地海关的要求为准。
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